A tale of two cesspits: DNA reveals intestinal health in Medieval Europe and Middle East
Исследование, опубликованное в журнале Philosophical Transactions of the Royal Society B, впервые применило методы обнаружения древних бактерий для характеристики микробного разнообразия кишечного содержимого из двух средневековых уборных XIV–XV веков в Иерусалиме и Риге (Латвия). Это даёт представление о микробиомах доиндустриальных сельскохозяйственных популяций, что может служить важным контекстом для оценки здоровья современных микробиомов.
Растущий объём данных связывает изменения в нашем микробиоме с болезнями современного индустриального мира, такими как воспалительные заболевания кишечника, аллергии и ожирение. Данное исследование помогает охарактеризовать эти изменения и подчёркивает ценность древних уборных как источников биомолекулярной информации.
Учёные идентифицировали широкий спектр бактерий, архей, простейших, паразитических червей, грибов и других организмов, включая таксоны, обитающие в кишечнике современных людей. Сравнение ДНК показало, что микробиомы Иерусалима и Риги, обладая некоторыми общими чертами, образуют уникальную группу, отличную как от современных индустриальных, так и от сообществ охотников-собирателей.
«Использование уборных, где фекалии многих людей смешиваются, дало нам беспрецедентное представление о микробиомах целых сообществ, — объясняет Пирс Митчелл из Кембриджского университета. — Сочетание световой микроскопии и анализа древней ДНК позволяет идентифицировать удивительное разнообразие организмов в кишечнике наших предков».