ДНК из сохранившихся фекалий раскрывает древнюю среду кишечника в Японии

ДНК из древних фекалий может дать археологам новые подсказки о жизни и здоровье японцев, живших тысячи лет назад. К такому выводу пришло исследование, опубликованное в PLOS ONE Лукой Нишимурой и Итуру Иноуэ из Национального института генетики Японии, Хироки Оота из Токийского университета, Маюми Адзимото из Исторического музея Вакаса и их коллегами.

Исследователи проанализировали генетические следы в четырёх копролитах (окаменевших фекалиях), собранных на археологическом объекте Торихама в Японии. Образцы возрастом от 5500 до 7000 лет относятся к раннему периоду Дзёмон. Учёные секвенировали весь генетический материал и сравнили найденную ДНК с известными последовательностями. В образцах были обнаружены фрагменты ДНК вирусов, гомологичных человеческому бетагерпесвирусу 5 и человеческому аденовирусу F.

Несмотря на высокую фрагментацию древней ДНК, этот анализ позволил оценить, какие микробы и вирусы могли присутствовать в пищеварительной системе людей тысячелетия назад. Авторы также отмечают, что сохранение в копролитах генетического материала как вирусов, так и бактерий может помочь в изучении долгосрочной коэволюции бактерий и поражающих их вирусов.