Генетическое разнообразие «вампирского» убийцы водорослей угрожает биотопливу

Новый анализ ДНК выявил неожиданное генетическое разнообразие у бактерии, представляющей постоянную угрозу для индустрии биотоплива из водорослей. Хищный вредитель с выразительным названием Vampirovibrio chlorellavorus высасывает содержимое клеток водорослей (отсюда и отсылка к вампирам), превращая продуктивный, процветающий зелёный водоём с водорослями в чан гниющего ила.

Исследовательская группа секвенировала два штамма Vampirovibrio из одного пруда. Образцы, собранные с разницей в год, происходили из системы культивирования водорослей под открытым небом в пустыне Сонора (Аризона). Геномный анализ выявил несколько предсказанных генов, кодирующих секретируемые белки, потенциально вовлечённые в патогенность, и как мини три, по-видимому, полных набора генов вирулентности (Vir), характерных для бактерий, осуществляющих вторжение в клетки.

Поскольку водоросли Chlorella являются ключевым источником биомассы для биотоплива и биопродуктов, важно углублять фундаментальное понимание взаимодействий между уникальным бактериальным патогеном и его зелёным водорослевым хозяином. Результаты этого исследования напрямую влияют на успех крупных коммерческих проектов по производству водорослей, направленных на повышение энергетической безопасности США и производство кормов для аквакультуры и нутрицевтиков.