Первые древние геномы герпесвируса документируют их долгую историю с людьми

Впервые ученые реконструировали древние геномы человеческих бетагерпесвирусов 6A и 6B (HHV-6A/B) из археологических останков человека возрастом более двух тысячелетий. Исследование под руководством Венского университета и Тартуского университета (Эстония), опубликованное в Science Advances, подтверждает, что эти вирусы эволюционировали вместе с людьми и внутри них, по крайней мере, с железного века. Результаты прослеживают долгую историю интеграции HHV-6 в человеческие хромосомы и предполагают, что HHV-6A рано утратил эту способность.

HHV-6B инфицирует около 90% детей к двум годам и наиболее известен как причина розеолы инфантум или «шестой болезни» — ведущей причины фебрильных судорог у маленьких детей. Вместе с близким родственником HHV-6A он относится к широко распространенным человеческим герпесвирусам, которые обычно устанавливают пожизненную латентную инфекцию после первоначального легкого заболевания в раннем детстве.

Их уникальность — способность интегрироваться в человеческие хромосомы. Эта особенность позволяет вирусу оставаться в спящем состоянии и, в редких случаях, передаваться по наследству как часть собственного генома хозяина. Такие унаследованные вирусные копии сегодня встречаются примерно у 1% людей. Хотя более ранние исследования предполагали, что эти интеграции древние, новые данные впервые предоставляют прямое геномное доказательство.

Международная исследовательская группа проанализировала почти 4000 образцов человеческих скелетов с археологических памятников по всей Европе. Было идентифицировано и реконструировано одиннадцать древних вирусных геномов — самый старый принадлежал девочке из железного века Италии (1100–600 гг. до н.э.). Остальные индивиды охватывали широкий географический и временной диапазон: оба типа HHV были обнаружены в средневековой Англии, Бельгии и Эстонии, а HHV-6B также найден в образцах из Италии и раннеисторической России. Несколько английских индивидов несли унаследованные формы HHV-6B, что делает их самыми ранними известными носителями хромосомно интегрированных человеческих герпесвирусов.

«На основе наших данных эволюцию вирусов теперь можно проследить за более чем 2500 лет по всей Европе, используя геномы с VIII–VI веков до н.э. и до сегодняшнего дня», — говорит ведущий исследователь Мериам Гуэллил из Венского университета.

Восстановленные геномы позволили определить, куда в хромосомах интегрировались вирусы. Сравнения с современными данными показали, что некоторые интеграции произошли очень давно и передавались из поколения в поколение на протяжении тысячелетий. Один из двух видов вируса (HHV-6A), по-видимому, со временем утратил способность интегрироваться в ДНК человека, что свидетельствует о разной эволюции этих вирусов при сосуществовании с человеческими хозяевами.

«Наличие копии HHV-6B в вашем геноме связывают со стенокардией и сердечными заболеваниями, — отмечает Шарлотта Хоулдкрофт из Кембриджского университета. — Мы знаем, что эти унаследованные формы HHV-6A и B сегодня более распространены в Великобритании по сравнению с остальной Европой, и это первое свидетельство древних носителей из Британии».

Обнаружение этих древних геномов HHV-6 дает первое датированное свидетельство долгосрочной коэволюции этого вируса с людьми на геномном уровне. «Современные генетические данные предполагали, что HHV-6 мог эволюционировать вместе с людьми с момента нашей миграции из Африки, — говорит Гуэллил. — Эти древние геномы теперь предоставляют первые конкретные доказательства их присутствия в глубоком прошлом человечества».