Расшифрован вирус гепатита Б каменного века

Международная команда учёных под руководством исследователей из Института науки об истории человечества Общества Макса Планка и Кильского университета успешно реконструировала геномы штаммов вируса гепатита B из Европы эпохи неолита и Средневековья. Эта беспрецедентная находка древней вирусной ДНК свидетельствует, что гепатит B циркулировал в Европе как минимум 7000 лет назад. Хотя древний вирус схож с современными, эти штаммы представляют собой отдельную, ныне, вероятно, вымершую линию, наиболее близкородственную вирусам шимпанзе и горилл.

Вирус гепатита B (HBV) — один из самых распространённых патогенов человека, поражающий более 250 миллионов человек в мире, но его происхождение и эволюционная история остаются неясными. Изучение эволюции вируса было особенно сложным, поскольку до сих пор не удавалось выделить вирусную ДНК из доисторических образцов. В данном исследовании, принятом к публикации в журнале eLife 10 мая 2018 года, учёные не только восстановили древнюю вирусную ДНК из скелетов, но и реконструировали геномы трёх штаммов HBV.

Для этого исследователи проанализировали образцы зубов 53 скелетов, раскопанных на неолитических и средневековых стоянках в Германии, возрастом от примерно 5000 года до н.э. до 1200 года н.э. Древний HBV был обнаружен у трёх индивидов, из которых восстановили полные геномы вируса: два неолитических (около 7000 и 5000 лет назад) и один средневековый. Неолитические геномы являются древнейшими из реконструированных на сегодняшний день.

Интересно, что древние геномы представляют собой отдельные линии, не имеющие близких родственников сегодня. Два неолитических генома, несмотря на разницу в 2000 лет, были относительно схожи между собой и более близки к современным штаммам HBV, обнаруженным у шимпанзе и горилл. Средневековый геном HBV больше похож на современные штаммы, но всё же представляет отдельную линию, даже по сравнению с двумя ранее опубликованными геномами из мумий XVI века, которые уже были близки к современным. Эти данные указывают на сложную историю вируса, возможно, включавшую множественные межвидовые передачи.

«В совокупности наши результаты показывают, что HBV уже существовал у европейцев 7000 лет назад, и его геномная структура была близка к современным вирусам гепатита B, несмотря на наблюдаемые различия», — объясняет первый автор Бен Краузе-Кёра. Он добавляет, что для понимания сложной эволюции вируса необходимо секвенировать больше древних предшественников, промежуточных и современных штаммов HBV человека и нечеловеческих приматов.

Старший автор Йоханнес Краузе подчёркивает главное значение работы: «Наши результаты раскрывают огромный потенциал древней ДНК из человеческих скелетов для изучения эволюции вирусов, передающихся через кровь. Теперь у нас есть мощный инструмент для исследования глубокой эволюционной истории вирусных заболеваний».