Исследование предполагает, что устрицы являются "горячей точкой" для снижения загрязнения питательными веществами

Новое исследование Виргинского института морских наук (William & Mary) впервые выявило и количественно оценило потенциально денитрифицирующие бактерии в кишечнике и на раковине устриц. Это также первая работа, использовавшая для таких целей новую компьютерную программу, которая предсказывает активность бактерий на основе последовательностей генов рибосомной РНК.

Полученные результаты важны для борьбы с эвтрофикацией прибрежных вод. Избыток азота из сточных вод, удобрений и других антропогенных источников может приводить к образованию бескислородных "мёртвых зон", снижению уловов и деградации местообитаний, например, в Чесапикском заливе. Денитрификация — это процесс, в ходе которого нитраты и нитриты преобразуются в безвредный газообразный азот. Ведущий автор исследования Энн Арфкен отмечает, что их работа — первая, изучившая потенциал денитрификации микробиомами, живущими внутри и на самих устрицах, а не в донных отложениях вокруг устричных рифов.

"Мы обнаружили, что раковины устриц содержат уникальные микробные сообщества с более высокой денитрифицирующей активностью, чем осадки", — говорит соавтор работы, профессор BK Song. Это означает, что удаление фиксированного азота может начинаться уже на ранних этапах проекта по восстановлению устриц благодаря активности микробиома раковин. Исследователи использовали метод "PAPRICA" (PAthway PRediction by phylogenetIC plAcement), чтобы по последовательностям гена 16S рРНК выявить бактерии, несущие гены денитрификации. Лабораторные измерения подтвердили более высокие скорости денитрификации в камерах с живыми устрицами и раковинами и выявили корреляцию с обилием гена nosZI. Учёные настроены оптимистично, но отмечают, что для валидации методов, основанных на анализе генов, и понимания сложной регуляции этих процессов требуется дальнейшая работа.