Ученые уточняют биологическое разнообразие в «тропическом леду для бедных»

Почва под нашими ногами не так биологически разнообразна, как считалось ранее. К такому выводу пришла исследовательская группа, в которую вошел микробный эколог из Технологического университета Вирджинии. Причиной переоценки стало так называемое «реликтовое ДНК» — остатки генетического материала от мертвых организмов, которое искажало прежние оценки разнообразия микробов в почве на величину до 55%.

Понимание истинного микробного разнообразия почвы критически важно для изучения ключевых экологических процессов, таких как фиксация атмосферного азота и изменение климата. Группа ученых, включая Майкла Стрикленда, использовала метод высокопроизводительного секвенирования, чтобы точно определить состав 31 образца почвы из различных климатических зон и экосистем. Результаты, опубликованные в журнале Nature Microbiology, показали, что значительная часть микроорганизмов, выявляемых с помощью ДНК-методов, на самом деле не являются живыми.

«Это исследование предполагает, что значительная часть микроорганизмов, обнаруженных в почве с помощью методов на основе ДНК, больше не жива», — прокомментировала Эмбер Моррисси из Университета Западной Вирджинии, не участвовавшая в работе. Для разделения живых клеток и генетических останков первый автор статьи, Пол Карини из Университета Колорадо в Боулдере, применил краситель PMA, который связывается с реликтовым ДНК, но не с живыми клетками.

Несмотря на уточнение в сторону уменьшения, почвенные микробные сообщества по-прежнему остаются чрезвычайно разнообразными. Как отметил Майкл Стрикленд, в одном грамме почвы могут обитать тысячи видов микробов, что позволило ему назвать почву «тропическим лесом для бедных».