Исследование выявило огромное разнообразие морских микробов

Передовые молекулярные методы позволили раскрыть разнообразие малоизученной группы океанических микробов — протистов, согласно новой публикации в Scientific Reports. Проект проанализировал образцы, собранные в ходе глобальной экспедиции Tara Oceans, задокументировав геномы, которые помогут исследователям идентифицировать протистов по всему океану.

Протисты формируют одни из самых сложных взаимоотношений с другими участниками микробной пищевой сети, включая паразитизм и стратегии питания, сочетающие фотосинтез и хищничество. Исследовательская группа проанализировала протистов из Индийского океана и Средиземного моря с помощью геномики одиночных клеток — набора молекулярных методов, раскрывающих генетические «чертежи» отдельных клеток. Впервые этот подход был применён ко всем микробным сообществам из разных локаций.

Исследователи задокументировали более 900 геномов одиночных клеток, на которые смогут опираться учёные по всему миру при идентификации протистов в будущем. Этот важный шаг поможет картировать микробные сообщества с помощью метагеномики — мощного метода одновременного анализа целых сообществ.

«Столько океанических протистов невозможно вырастить в лаборатории, поэтому мы должны искать способы изучать их в их естественной среде, — сказал ведущий автор исследования Майк Сираки. — Каждая капля морской воды содержит микробные экосистемы, о которых мы знаем очень мало, и крайне важно понять эту фундаментальную экосистему нашей океанической планеты Земля и то, как она реагирует на изменения».

«Протисты — самые многочисленные хищники океана, но мы всё ещё мало знаем о том, кто они и что делают в природе, — отметил Рамунас Степанаускас, старший научный сотрудник и директор Центра геномики одиночных клеток. — Мы начинаем раскрывать полный масштаб разнообразия и экологических ролей этих увлекательных компонентов морских экосистем».