Исследование почвы Нью-Йорка обнаруживает микробы, производящие лекарства

Исследователи из Университета Рокфеллера обнаружили, что почва под Нью-Йорком изобилует бактериями, способными производить широкий спектр соединений с потенциалом для создания новых лекарств. Работа описана в Proceedings of the National Academy of Sciences.

Почва, насыщенная конкурирующими микробами, является богатым источником лекарств микробного происхождения. Однако лишь небольшая часть почвенных бактерий может быть выращена в лаборатории. Лаборатория Шона Брэди обходит эту проблему, анализируя непосредственно бактериальную ДНК в почве, чтобы найти генетические инструкции для создания целебных молекул. В сотрудничестве с организацией Natural Areas Conservancy были собраны 275 образцов верхнего слоя почвы из парков города.

Анализ показал огромное генетическое разнообразие. Например, один образец из Проспект-парка в Бруклине содержал гены, вероятно кодирующие 25 молекул, изучаемых как потенциальные антибиотики и другие лекарства. При этом кластеры генов, кодирующие 11 известных соединений, таких как антибиотик эритромицин, были также обнаружены в почве городских парков. Ключевым открытием стало обилие незнакомых генов: менее одного процента последовательностей, кодирующих молекулы, соответствовали известным генам.

«На протяжении всей истории этой области существовала идея, что для сбора необычных бактерий нужно ехать в удаленные части мира. Но эти среды хрупки и исчезают, — говорит Шон Брэди. — Между тем мы обнаруживаем, что с помощью современных методов секвенирования можно найти все те же потенциально полезные молекулы на нашем собственном заднем дворе». Лаборатория продолжает исследовать образцы почвы со всей территории США.