Разбавленное биоразнообразие: тип образца критически важен в исследованиях экологической ДНК для биомониторинга

Международная группа учёных из Центра геномики биоразнообразия Университета Гвельфа и Министерства окружающей среды и изменения климата Канады опубликовала в журнале PLOS One исследование, сравнивающее эффективность двух методов отбора проб для ДНК-биомониторинга пресноводных макробеспозвоночных. Сравнивались совпадающие по локации пробы воды и пробы бентоса (скопления организмов).

Исследование показало, что между пробами бентоса и воды обнаружено очень мало общих таксонов, при этом в бентосе зафиксировано гораздо большее богатство видов макробеспозвоночных. Ключевые биоиндикаторные группы EPTO (подёнки, веснянки, ручейники, стрекозы) были чётко ассоциированы с пробами бентоса, тогда как в пробах воды было обнаружено ограниченное число их семейств.

Выбор метода отбора проб является критическим фактором для всесторонней оценки общего биоразнообразия. Работа демонстрирует, что для доступа к ДНК макробеспозвоночных пробы воды не могут заменить сбор организмов из бентоса, так как большинство важных индикаторных таксонов в воде не обнаруживаются, даже когда известно об их присутствии в экосистеме.

«Эта нетронутая водно-болотная система отлично подходит для сравнения относительной обнаруженности этих таксонов без влияния течения воды», — отметил ведущий автор, профессор Мехрдад Хажибабаи. Соавтор доктор Дональд Бэйрд подчеркнул: «Обнаруживаемость видов — важный аспект при проектировании программ биомониторинга». Исследование подтверждает, что для создания качественных базовых данных о здоровье водоёмов необходимы стандартизированные и репрезентативные методы отбора проб, такие как сбор бентоса.