Первый геном жителя Помпеи секвенирован
Впервые успешно секвенирован геном человека, погибшего в Помпеях, Италия, после извержения Везувия в 79 году нашей эры. Результаты исследования представлены на этой неделе в журнале Scientific Reports. Ранее были секвенированы лишь короткие участки митохондриальной ДНК из останков людей и животных, найденных в Помпеях.
Габриэле Скоррано и его коллеги исследовали останки двух человек, обнаруженных в Доме ремесленника в Помпеях, и извлекли их ДНК. Анализ скелетов показал, что один набор останков принадлежал мужчине в возрасте 35–40 лет, а другой — женщине старше 50 лет. Учёным удалось извлечь и секвенировать древнюю ДНК из обоих образцов, но полностью собрать геном получилось только у мужчины из-за пробелов в последовательностях, полученных от женщины.
Сравнение ДНК мужчины с данными 1030 других древних и 471 современного жителя Западной Евразии показало, что его геном наиболее схож с геномами современных жителей центральной Италии и других людей, живших в Италии в эпоху Римской империи. Однако анализ его митохондриальной ДНК и Y-хромосомы также выявил группы генов, типичные для населения острова Сардиния, но не встречавшиеся у других жителей Италии того периода. Это говорит о возможном высоком уровне генетического разнообразия на Апеннинском полуострове в ту эпоху.
Дополнительный анализ скелета и ДНК мужчины выявил поражения в одном из позвонков и последовательности ДНК, характерные для бактерий рода Mycobacterium, к которому относится и возбудитель туберкулёза Mycobacterium tuberculosis. Это позволяет предположить, что индивид мог страдать от туберкулёза до своей гибели.
Авторы предполагают, что успешное восстановление древней ДНК из останков мужчины могло стать возможным благодаря тому, что пирокластические материалы, выброшенные при извержении, могли защитить их от разрушающих ДНК факторов окружающей среды, таких как атмосферный кислород. Полученные результаты демонстрируют возможность извлечения древней ДНК из останков жителей Помпеев и позволяют глубже понять генетическую историю и жизнь этого населения.
