Методы отслеживания микробного фекального загрязнения воды

Микробиолог Андреас Фарнляйтнер в рамках проекта, поддержанного Австрийским научным фондом FWF, исследует новые методы анализа фекального загрязнения воды. Используя ДНК-аналитику, учёный стремится разработать комплексные и простые методы для определения масштаба и происхождения такого загрязнения.

В настоящее время вода, доступная как минимум 1,5 миллиардам людей, загрязнена фекалиями, что ежегодно вызывает около 500 000 заболеваний. Существующий более 120 лет стандартный метод обнаружения в воде кишечной палочки (Escherichia coli) не позволяет определить источник загрязнения (животное или человек) и оценить конкретные риски для здоровья. Цель проекта — создать более точные и быстрые аналитические методы.

Исследование сосредоточено на так называемых «обильных бактериях, ассоциированных с хозяином», которые присутствуют в кишечнике в гораздо больших количествах, чем E. coli, но не культивируются стандартными методами. Их можно обнаружить напрямую по ДНК. Для этого команда создала базу данных микроорганизмов, проанализировав экскременты более 450 различных животных, включая птиц, рептилий, амфибий и рыб, а также образцы почвы. На данный момент проанализировано 23 миллиона последовательностей ДНК.

«В будущем мы сможем использовать результаты для полевых тестов и методов быстрого обнаружения, работающих на открытом воздухе с помощью простых инструментов, — говорит Фарнляйтнер. — Это развитие революционизирует анализ качества воды».