Генетическое секвенирование выявило неожиданный источник патогенов в паводковых водах

Исследователи сообщают в журнале Geohealth, что местные реки и ручьи, а не предполагавшиеся ранее многочисленные свинофермы, стали источником заражения бактериями Salmonella enterica в прибрежной части Северной Каролины после урагана «Флоренс» в 2018 году.

Эти выводы имеют критическое значение для контроля распространения болезней, вызываемых устойчивыми к антибиотикам патогенами, после наводнений. Это особенно актуально для прибрежных регионов развивающихся стран, сильно страдающих от учащения тропических штормов.

«Инфекции, вызванные устойчивыми к антибиотикам патогенами, являются причиной примерно 2,8 миллиона заболеваний и 36 000 смертей в год только в США», — сказала руководитель исследования, профессор гражданского и экологического строительства Хелен Нгуен. Поскольку в паводковых водах часто находят генетические маркеры человеческих и животных фекалий, обычно винят сточные воды, септики и животноводческие фермы. Однако команда Нгуен, проанализировав хромосомы и плазмиды с помощью высокоточного полногеномного секвенирования, обнаружила, что штаммы S. enterica в 23 из 25 проб, взятых через три недели после урагана, имеют не животное происхождение.

Генетический анализ проследил источник бактерий до множества небольших местных рек и ручьев, что означает укоренение этих патогенов в естественной среде. «С изменением климата, приносящим более теплые температуры — идеальные для бактерий — и, возможно, более крупные и частые тропические штормы, наши выводы должны быть осознаны исследователями и политиками, — подчеркнула Нгуен. — При разработке планов по предотвращению распространения патогенных бактерий после ураганов нельзя рассматривать только сельскохозяйственные и бытовые сточные воды».