Выявление близких и дальних родственников в древней ДНК с беспрецедентной точностью

Исследователи из Института эволюционной антропологии общества Макса Планка (Лейпциг, Германия) и Гарвардского университета (США) разработали новый мощный инструмент под названием "ancIBD" для выявления сегментов идентичности по происхождению (IBD) в геномах людей, живших сотни, тысячи или даже десятки тысяч лет назад. Результаты опубликованы в журнале Nature Genetics.

Ключевой задачей было то, что древние геномы часто сильно деградированы. Учёные использовали инновационный подход, заполняя пробелы в древних геномах с помощью современных референсных панелей ДНК. Это позволило анализировать древнюю ДНК совершенно новыми способами. "Точно измеряя участки общего генома, мы теперь можем обнаруживать пары родственников вплоть до шестой степени родства и в древних геномах, в то время как предыдущие методы анализа древней ДНК, основанные на среднем геномном сходстве, были ограничены обнаружением родства только до третьей степени", — объясняет Илей Хуан, первый автор исследования.

Применив новый инструмент к набору данных из 4248 ранее опубликованных древних геномов из Евразии возрастом до 50 000 лет, авторы выявили сотни ранее не обнаруженных пар родственников. В некоторых случаях родственники были захоронены на большом расстоянии друг от друга, что прямо указывает на мобильность древних людей. Например, была обнаружена пара кочевников раннего бронзового века из Центральной Азии (около 5000 лет назад), являвшихся родственниками пятой степени и захороненных примерно в 1500 км друг от друга.

Инструмент также позволил с беспрецедентной точностью исследовать даже более дальних родственников. "Мы обнаружили увлекательные связи между древними культурами, и сигнал длинных общих сегментов позволил нам впервые конкретно продемонстрировать тесные отношения между важными древними культурами, иногда на огромных пространствах в масштабе всего нескольких сотен лет", — говорит ведущий исследователь Харальд Рингбауэр. Новый метод даёт исследователям универсальный вычислительный инструмент для изучения жизни наших предков.